一些作者虽然查阅了文献，但针对繁多的文献，又不懂得如何选择，常会因不恰当选用参考文献而影响了论文的质量，常见问题如下。

1.未亲自阅读参考文献，而交叉引用其它研究论文的参考文献，这是最常见的错误之一。因作者未亲自查找、阅读该参考文献，而直接抄袭其它论文的参考文献，将所引用的内容和文献出处照搬过来，对其中的错误未能识别，容易造成文题、作者姓名、期刊名称和页码等错误以及卷(期)数不清。又因未阅读全文，往往片面地理解所引用内容，以致错误地引用别人的观点、结论，弄巧反拙，严重地损害了论文的质量

2.参考文献盲目滥用或堆砌。一些作者误认为参考文献越多，论文越有说服力，因此在文中引用过泛，甚至以文献代替讨论等，结果适得其反。亦有一些作者仅将参考文献视作论文的一种必须格式，对参考文献不加选择，信手拈来几条堆砌起来以支撑门面，参考文献自然起不到应有的作用。另有一些作者喜欢引用某些参考文献，用以说明自己的结果与其一致，这种“重复性研究”亦无大的价值及意义。

3.引用的参考文献陈旧。由于未作全面检索，而未能选用近期该领域的文献，有些引用好几年前甚至十几年前的文献。一般认为，除了一些经典的医学理论外，大多数医学文献会在约五年以后被逐步更新或淘汰。若再选用这些参考文献，就造成论文知识结构陈旧，欠缺先进性，影响论文质量的提高。

4.其它的不恰当引用参考文献，包括:①未引用有该项研究的核心期刊，而引用次要期刊甚至非正式出版物发表的文献；②未引用该项研究权威人士撰写的论文，而选用一些影响力较小的文章；③选用一些和自己论文关系不大的文献；④由于检索条件所限，或出于某些原因，多选用自己的文献，或单一选用某一种杂志文献，如一些临床医生只查阅临床专业期刊，而忽视对院校学报的检索，造成参考文献狭窄、片面，失去了其应起的作用。